Pourquoi l'Atlas?
Le cancer est la seconde cause de mortalité en France
- Il est aussi la première cause de mortalité prématurée (> 35% des décès avant 65 ans).
- Il n'y a pas "un cancer" mais "des cancers". Les cancers sont des maladies génétiques acquises et les combattre nécessite de connaître leurs caractéristiques afin d'adapter la stratégie thérapeutique au cas par cas. Les exemples de traitement par l'ATRA ou de l'Imatinib montrent que la génétique des cancers permet de les traiter efficacement en fonction de leurs caractéristiques génétiques propres. L'Atlas est le collecteur des informations éparses sur la génétique des cancers; il est ainsi le point de départ de recherches nouvelles, du développement de nouvelles thérapeutiques mais aussi la référence pour les diagnostics et la prise en charge thérapeutique des nouveaux patients dans les hôpitaux.
- Le pronostic d'une leucémie dépend des gènes touchés: moyenne de survie dans une leucémie : 3 mois, taux de guérison dans une autre : 95 %. Il est donc nécessaire d'avoir à disposition une connaissance des gènes impliqués si l'on veut sauver ces patients. Mais près de 9 000 gènes peuvent être impliqués dans le cancer.
- Par ailleurs, certaines pathologies sont très fréquentes quand d'autres sont très rares, en particulier certaines leucémies, et il y a plus de 900 leucémies différentes ! Cet afflux croissant de connaissances nécessite donc un effort collectif qui peut être facilité par les outils informatiques du web, permettant la gratuité, y compris pour le tiers monde.
- Avec le développement des techniques, il apparait maintenant que, comme les leucémies, les tumeurs solides, comportent de nombreuses sous-classes (Ex : bientôt combien de centaines de cancers du sein, portant des profils génétiques distincts, et donc des traitements distincts?).
En quoi l'Atlas peut-il être utile ?
- L'Atlas aide à la compréhension des anomalies génétiques, ce qui permet la compréhension de la maladie. Il permet au cytogénéticien de comparer les résultats de son analyse à l'iconographie et aux textes de références ; il affine son diagnostic avant de le délivrer au clinicien.
- C'est un gain de temps pour le clinicien et, de ce fait, un gain de temps pour la prise en charge thérapeutique des patients. Les données obtenues dans l'Atlas guident la décision thérapeutique: on ne va pas prendre le risque d'un traitement très lourd pouvant tuer le malade (par exemple greffe de moelle osseuse) pour une leucémie "peu grave"; par contre, il faudra prendre ce risque pour une leucémie foudroyante.
- L'Atlas est une aide importante pour la formation des étudiants en médecine, pharmacie, biologie et école d'infirmières.
- L'Atlas aide le chercheur : c'est une importante base de données, présentant des revues de la littérature ; il y est décrit le gène, ses exons, les domaines de la proteine, son mode d'action au sein de la cellule, les voies impliquées (ex : transduction du signal, apoptose, cycle cellulaire), le mode d'oncogénèse probable, les pathologies où ce gène intervient.
Objectifs du projet
- Aide au traitement des formes les plus rares de cancer
- Gain d’efficacité dans la lutte contre le cancer
- Diminution des coûts de la médecine et de la recherche fondamentale
- Médecine personnalisée des cancers (axe du plan cancer 2014?2018)
Mots-clefs
- Mutualisation des connaissances sur la biologie de la cellule normale et cancéreuse
- Outil référentiel et d'investigation pour la recherche
- Support pédagogique multilingue
- Recherche translationnelle
- Transfert de l’innovation scientifique vers 1- la recherche et vers 2- les soins aux patients